中国科学院期刊「国家科学评论」3日发表文章,指2019冠状病毒近期产生149个突变点,演化出L亚型和S亚型2种亚型。其中,S型是相对更古老的版本,而L型更具侵略性、传染力更强。
所谓「亚型」指的是病毒因基因(DNA)排序不同,产生蛋白质形式上的变异。
澎湃新闻今天报导,这篇题为「关于SARS-CoV-2的起源和持续进化」(On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2)的论文,通讯作者为北京大学生命科学学院生物信息中心研究员陆剑、中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰。
论文透过对目前为止最大规模的103个新冠病毒全基因组分子进化分析,发现病毒株已发生149个突变点,且多数是近期产生。病毒已演化出L和S两个亚型,其中101个突变点属于这两个亚型。
论文指出,从比重上看,L亚型更为普遍达到70%,S亚型占30%。这103个样本显示,大部分患者只感染了L亚型或S亚型其中一个。但有一例近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株,显示可能同时感染了L型和S型。但作者表示,目前还无法排除新突变型的可能性。
另外,在这篇研究当中,共有3例台湾样本,其中2例为L型,1例为S型。
透过与其他冠状病毒比较,作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点,L亚型是T碱基(对应亮氨酸,Leu),S亚型是C碱基(对应丝氨酸,Ser)。
论文认为,根据病毒演变方式推测,L亚型和S亚型的传播能力、致病严重程度或许存在较大区别。
论文指出,L亚型在武汉爆发疫情的早期阶段更为普遍,发生频率则在今年1月初后有所下降。作者认为,人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力,如果没有这些干预,L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速。
另一方面,由于选择压力相对较弱,在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加。这些发现意味着,目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒疾病患者临床症状图表记录,进行进一步全面研究。
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